扁桃体切除术一度使用得很普遍，因为切除了扁桃体就不会再患扁桃体炎了。但是切除扁桃体只能中度地减少咽炎的频率和严重性，并不能彻底地防止咽炎的发生，切除扁桃体会影响到儿童的免疫防御，因此有比较严格的条件。
如果扁桃体炎经常复发、慢性扁桃体炎、细菌性扁桃体炎抗生素治疗无效的话，可以手术切除扁桃体。经常复发的扁桃体炎指的是每年发作7次之上，或者连续两年每年发作5次以上，或者连续三年每年发作3次以上。除此之外，如果出现难缠的并发症的话，比如睡眠呼吸暂停、呼吸困难、吞咽固体食物困难、经抗生素治疗后脓肿没有改善等情况，也要进行手术切除。
不满足这些条件的话，通常不进行手术切除。
尽管如此，现在切除扁桃体的孩子中有很多不符合条件。美国15岁以下儿童每年超过53万例扁桃体切除术。这种手术安全系数很高，但依然有一定的风险。尤其是出血和感染，术后出血的发病率为2%到4%，因为出血、气管堵塞或麻药合并症而死亡的比例为1:。
根据统计，切除扁桃体之后，做手术的孩子和没有切除扁桃体的孩子相比，每年患咽炎的天数会少5天。这种区别在1到2年后就消失了，两组孩子患咽炎的天数都大幅度下降，这是国外的资料。中国的孩子因为种种原因，比如传染病多发、空气污染，患咽炎的次数高，也许会有更多的获益。另外一点，在国外切除扁桃体是全身麻醉，因此要承担全麻的风险，国内则局麻为主，虽然让孩子感觉不舒服，但减少了一定的风险，因此中国做扁桃体切除术比国外利多了一些。
京虎子